Ingenieur informatique data management des donnees de sante H/F

CENTRE DE RESSOURCES BIOLOGIQUES DIRECTION DE LA RECHERCHE ET DE L'INNOVATION CDD 12 MOIS - TEMPS PLEIN A POURVOIR A COMPTER DU 01 JANVIER 2027

Nous cherchons un(e) ingénieur data souhaitant travailler sur un projet ambitieux visant à exploiter de grands volumes de données pour enrichir les données des collections biologiques du CRB à partir de l'EDS et à faciliter leur exploitation statistique au service des projets de recherche.

1. Missions générales

Sous la responsabilité des coordonnateurs du CRB et de l'EDS, et en lien fonctionnel étroit avec les cliniciens responsables des collections biologiques, les principales missions seront de :

• Participer au développement et à la maintenance des processus d'extraction, de transformation et de chargement (ETL) des données du système d'information vers i2b2 et OMOP, nécessaires aux besoins du CRB ;
• Participer aux activités de data management des données pour les projets de recherche en lien avec le CRB (identification, structuration et intégration dans un eCRF des données de l'EDS nécessaires au projet) en coordination avec les cliniciens référents de chaque collection ;
• Analyser les besoins et réaliser des développements spécifiques de traitement automatique de la langue pour les cas d'usage du CRB nécessitant de recueillir des informations mentionnées en texte libre ;
• Interroger les données de l'EDS pour répondre à des études de faisabilité en lien avec le CRB.
• Contribuer à l'analyse des trajectoires de santé des patients inclus dans les collections (évolution de paramètres cliniques et biologiques dans le temps, identification de la survenue d'événements de santé d'intérêt), au-delà du seul travail de structuration des données, via des approches de modélisation simple adaptées aux besoins des cliniciens.

2. Nature du contrat et des conditions de recrutement

• Le poste est à pourvoir en CDD de 12 mois à compter du 1 janvier 2027
• Votre rémunération sera fixée en fonction de votre formation et de votre expérience, sur un grade d'Ingénieur Hospitalier, catégorie A (grille indiciaire de la fonction publique hospitalière) soit un salaire à partir de 28K€ brut/an
• Possibilité de télétravail 1 à 2 jours par semaine

3. Quotité de temps de travail

Temps plein = 100%

PROFIL RECHERCHE

• Diplôme Bac +5 en en statistique, mathématiques appliquées ou informatique avec une orientation donnée de santé ;
• Expertise en gestion de bases de données ;
• Maîtrise du langage SQL ;
• Maîtrise d'un langage de traitement des données (Python ou R);
• Expériences dans les algorithmes de TAL et des métriques d'évaluation, notamment en reconnaissances d'entités nommées et en classification automatique de textes ;
• Compétences en modélisation statistique appliquée aux trajectoires de santé (modèles de survie, régressions) ;
• Connaissance de Git ;
• Connaissance de Linux ;
• Serait un plus :

o Une expérience en épidémiologie clinique ou en intégration de cohortes longitudinales Une expérience dans le domaine de la santé o La connaissance de Docker

• Rigueur, autonomie, sens de l'organisation.

Capacités particulières : Le (la) candidat(e) devra en outre avoir les qualités humaines et relationnelles adaptées au travail au sein d'une équipe composite, dynamique et pluridisciplinaire intégrant médecins, informaticiens, attachés de recherche clinique, chef de projet et gestionnaire administratif.

Déposez dès maintenant votre candidature (CV et lettre de motivation) sur le site web du CHU de Poitiers, rubrique « Le CHU recrute », la date limite de dépôt est le 8 novembre 2026.